Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP3Q96P20 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms