Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SFXN2Q96NB2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SFXN2Q96NB2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms