Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPATA13Q96N96 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms