Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF396Q96N95 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF396Q96N95 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms