Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms