Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C2orf48Q96LS8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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