Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD3Q96L08 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms