Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LRRIQ1Q96JM4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
LRRIQ1Q96JM4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
LRRIQ1Q96JM4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms