Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VCPIP1Q96JH7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VCPIP1Q96JH7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VCPIP1Q96JH7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms