Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF479Q96JC4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms