Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP3Q96JB5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms