Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNF8Q96H20 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNF8Q96H20 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms