Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IMP4Q96G21 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IMP4Q96G21 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP4Q96G21 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms