Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF21BQ96EK2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF21BQ96EK2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms