Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATG4CQ96DT6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG4CQ96DT6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms