Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C18orf8Q96DM3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms