Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF653Q96CK0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF653Q96CK0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms