Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NSUN4Q96CB9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NSUN4Q96CB9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms