Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG2BQ96BY7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG2BQ96BY7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG2BQ96BY7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms