Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-CQ95604 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-CQ95604 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-CQ95604 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms