Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP13Q92995 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP13Q92995 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP13Q92995 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP13Q92995 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP13Q92995 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP13Q92995 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP13Q92995 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP13Q92995 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP13Q92995 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP13Q92995 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP13Q92995 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP13Q92995 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP13Q92995 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP13Q92995 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP13Q92995 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP13Q92995 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP13Q92995 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP13Q92995 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP13Q92995 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP13Q92995 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP13Q92995 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP13Q92995 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP13Q92995 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP13Q92995 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP13Q92995 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP13Q92995 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP13Q92995 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP13Q92995 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP13Q92995 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP13Q92995 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP13Q92995 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP13Q92995 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP13Q92995 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP13Q92995 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP13Q92995 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP13Q92995 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP13Q92995 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP13Q92995 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP13Q92995 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP13Q92995 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP13Q92995 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP13Q92995 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP13Q92995 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP13Q92995 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP13Q92995 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP13Q92995 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP13Q92995 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP13Q92995 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP13Q92995 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP13Q92995 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP13Q92995 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP13Q92995 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP13Q92995 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP13Q92995 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP13Q92995 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP13Q92995 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP13Q92995 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP13Q92995 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms