Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDKL2Q92772 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL2Q92772 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms