Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ73

RFFL, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFFLQ8WZ73 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFFLQ8WZ73 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFFLQ8WZ73 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms