Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PHIPQ8WWQ0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PHIPQ8WWQ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHIPQ8WWQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHIPQ8WWQ0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms