Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TMEM239Q8WW34 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TMEM239Q8WW34 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TMEM239Q8WW34 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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TMEM239Q8WW34 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM239Q8WW34 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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TMEM239Q8WW34 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM239Q8WW34 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM239Q8WW34 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TMEM239Q8WW34 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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TMEM239Q8WW34 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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TMEM239Q8WW34 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM239Q8WW34 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM239Q8WW34 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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TMEM239Q8WW34 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM239Q8WW34 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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TMEM239Q8WW34 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM239Q8WW34 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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TMEM239Q8WW34 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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TMEM239Q8WW34 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM239Q8WW34 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM239Q8WW34 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM239Q8WW34 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM239Q8WW34 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM239Q8WW34 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM239Q8WW34 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM239Q8WW34 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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