Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX54Q8TDD1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX54Q8TDD1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms