Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPPL3Q8TCT6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPPL3Q8TCT6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPPL3Q8TCT6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms