Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM58Q8NG06 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM58Q8NG06 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms