Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU7

TET1, Methylcytosine dioxygenase TET1, humanhuman

Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TET1Q8NFU7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TET1Q8NFU7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TET1Q8NFU7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TET1Q8NFU7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms