Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDPRQ8NCN5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDPRQ8NCN5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms