Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL23Q8NBE8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms