Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFSD2AQ8NA29 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms