Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAAF3Q8N9W5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF3Q8N9W5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF3Q8N9W5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms