Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NECAB1Q8N987 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECAB1Q8N987 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms