Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHCHD4Q8N4Q1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms