Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms