Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A6

C4orf33, UPF0462 protein C4orf33, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf33Q8N1A6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf33Q8N1A6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4orf33Q8N1A6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms