Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMYD4Q8IYR2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms