Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIX1LQ8IVB5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIX1LQ8IVB5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms