Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VPS37DQ86XT2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS37DQ86XT2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms