Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP9Q7RTR0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP9Q7RTR0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms