Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPCAT2Q7L5N7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms