Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SV2BQ7L1I2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SV2BQ7L1I2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms