Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUFY3Q7L099 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms