Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP31Q70CQ4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP31Q70CQ4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
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