Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS12Q6ZW61 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms