Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYDE1Q6ZW31 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYDE1Q6ZW31 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms