Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM47EQ6ZV65 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM47EQ6ZV65 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms