Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM43BQ6ZT52 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM43BQ6ZT52 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms