Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C15orf39Q6ZRI6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C15orf39Q6ZRI6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms